Co-ip染色质免疫共沉淀准备工作

更新时间：2023-03-07

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　　Co-ip染色质免疫共沉淀准备工作：

　　1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次，后一次吸干PBS;

　　2. Co-ip染色质免疫共沉淀加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107个细胞、10cm培养皿或150cm2培养瓶，0.5ml/5×106个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶)

　　3. Co-ip染色质免疫共沉淀用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下，把悬液转到1.5EP管中，4℃，缓慢晃动15min(EP管插冰上，置水平摇床上)

　　4. 4℃，14000g离心15min，立即将上清转移到一个新的离心管中

　　5. 准备Protein A agarose，用PBS 洗两遍珠子，然后用PBS配制成50%浓度，建议减掉枪尖部分，避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠

　　6. 每1ml总蛋白中加入100μl Protein A琼脂糖珠(50%)，4℃摇晃10min(EP管插冰上，置水平摇床上)，以去除非特异性杂蛋白，降低背景

　　7. 4℃，14000g离心15min，将上清转移到一个新的离心管中，去除Protein A珠子

　　8. (Bradford 法)做蛋白标准曲线，测定蛋白浓度，测前将总蛋白至少稀释1：10倍以上，以减少细胞裂解液中去垢剂的影响(定量，分装后，可以在-20℃保存一个月)

　　9. Co-ip染色质免疫共沉淀用PBS将总蛋白稀释到约1 μg/μl，以降低裂解液中去垢剂的浓度，如果兴趣蛋白在细胞中含量较低，则总蛋白浓度应该稍高(如10 μg/μl)

　　10. 加入体积的兔抗到500μl总蛋白中，抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异

　　11. 4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2h，激酶或磷酸酯酶活性分析建议用2 h室温孵育

　　12. 加入100μl Protein A琼脂糖珠来捕捉抗原抗体复合物，4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1h，如果所用抗体为鼠抗或鸡抗，建议加2 μl"过渡抗体"(兔抗鼠IgG，兔抗鸡IgG)

　　13. 14000rpm瞬时离心5s，收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物，去上清，用预冷的RIPA buffer洗3遍，800μl/遍，RIPA buffer有时候会破坏琼脂糖珠-抗原抗体复合物内部的结合，可以使用PBS

　　14. Co-ip染色质免疫共沉淀用60μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起，轻轻混匀，缓冲液的量依据上样多少的需要而定(60 μl足够上三道)

　　15. 将上样样品煮5min，以游离抗原，抗体，珠子，离心，将上清电泳，收集剩余琼脂糖珠，上清也可以暂时冻-20℃，留待以后电泳，电泳前应再次煮5min变性。

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